蒸汽消毒型凍干機(jī)采用在位滅菌裝置SIP(121oC蒸汽滅菌,雙氧水滅菌裝置)，從根本上避免了無菌室的二次污染問題?？上镜牟y管套有效地防止了液壓油的污染。使用蒸汽消毒的凍干機(jī)本身相當(dāng)于一臺(tái)高壓消毒柜，凍干箱和水汽凝結(jié)器均使用蒸汽消毒，因此它們必須不僅能耐受負(fù)壓，而且要耐受正壓，二者均裝有安全放氣閥，為了消毒后冷卻系統(tǒng)，大型凍干機(jī)的凍干箱和水汽凝結(jié)器均設(shè)計(jì)成雙層夾套式結(jié)構(gòu)，以便用冷卻水進(jìn)行冷卻，大型凍干機(jī)的箱門也是雙層夾套式結(jié)構(gòu)。凍干機(jī)的箱門需適合耐正壓，因此普遍采用像高壓消毒柜那樣的輻射桿式鎖緊裝置，并裝有安全設(shè)備，當(dāng)凍干箱內(nèi)處于正壓和高溫時(shí)，凍干箱門無法打開。
     為了提高消毒效果和縮短消毒時(shí)間，消毒方式均為預(yù)真空式，因此凍干機(jī)帶有一臺(tái)水環(huán)式真空泵，除抽空系統(tǒng)之外，還用于消毒結(jié)束后抽除水分，作為系統(tǒng)的干燥之用。
    為了適應(yīng)蒸汽消毒的高溫（最高達(dá)138℃），凍干箱板層內(nèi)的傳溫流體需采用耐高溫型流體?，F(xiàn)在大都采用硅油；也有采用三氯乙烯的，但需用氮?dú)饧訅?，以提高沸點(diǎn)。真空測(cè)量頭也要求采用耐高溫高壓型的探頭。最好使用電容式真空儀表。對(duì)于帶有箱內(nèi)壓塞裝置的凍干機(jī)，為了達(dá)到嚴(yán)格消毒的目的，在液壓活塞桿上應(yīng)加上一個(gè)不銹鋼的波紋管套管。
     現(xiàn)代凍干機(jī)的蒸汽消毒可以預(yù)先編制程序，全自動(dòng)地進(jìn)行操作。蒸汽消毒大致有如下步驟：
1．  關(guān)閉凍干箱和水汽凝結(jié)器與外界相通的閥門，關(guān)閉真空泵和水汽凝結(jié)之間的閥門。
2．  用水環(huán)式真空泵抽空系統(tǒng)，鎖緊箱門。
3．  放入蒸汽進(jìn)行升溫，抽空系統(tǒng)，重復(fù)三次。
4．  在規(guī)定的溫度進(jìn)行保溫或保壓。
5．  冷卻干燥階段，用水環(huán)式真空泵進(jìn)行抽空，并用冷凍機(jī)降溫。

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